何もコマンドを付けづに普通にcloneするとmasterが選択されます。

 
特定ブランチをcloneしたい場合は-bコマンドを利用する事で実現可能です。
 

 
URLの後に適当な名前を付けておくとその名前でlocalにcloneする事が可能です。

 

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